ارائه روش محاسباتی جدید برای تعیین توالی رشته های DNA در دانشگاه تربیت مدرس

پژوهشگران علوم ریاضی دانشگاه تربیت مدرس روش جدید محاسباتی، ساده تر و کارآمد تر بر پایه نظریه گراف برای تعیین توالی رشته های  DNA  با نانو حفره ها ارائه کردند.

کد خبر: ۱۷۵۶۸۸

يکشنبه - ۱۴ اسفند ۱۳۹۰ / March 04, 2012

به گزارش گروه علمي «خبرگزاري دانشجو»، نفیسه السادات جعفرزاده، كارشناس ارشد ریاضی محض و مجری طرح تحقیقاتی «روش محاسباتی جدید برای تعیین توالی رشته های DNA»  گفت: در این پژوهش، ابتدا به مطالعه درباره گراف های برچسب دار DNA و ویژگی های آن پرداخته شده است.

وی افزود: در ادامه پژوهش درباره گراف DNA که حالت خاصی از گراف های بر چسب دار DNA است، بحث کرده و با استفاده از مفهوم این گراف، یک روش جدید محاسباتی بر پایه نظریه گراف برای تعیین توالی رشته های  DNA با نانو حفره ها ارائه شد.

جعفرزاده در خصوص ویژگی های روش جدید ارائه شده در این پژوهش گفت: در مقایسه با روش های ارائه شده بوسیله نویسندگان دیگر، روش ما از این رو که مستقل از طول الیگنوکلئوتیدها (k) است، ساده تر و کارآمد تر است.

پژوهشگر دانشگاه تربیت مدرس اظهار داشت: در ادامه برای مشخص سازی رشته های DNA، بوسیله بعضی از عناصر نظریه گراف و توصیف گرهای ریاضی، یک نمایش جدید گرافی و عددی برای آنالیز کردن رشته های DNA بر اساس کدون ها، ارائه شد كه سودمندی روش ما بوسیله یک محک برای تشابه بین یک ژن انسانی و هشت نوع ژن دیگر، شرح داده شد.

گفتنی است، این پژوهش با راهنمایی دکتر علی ایرانمنش عضو هیئت علمی دانشگاه انجام شده است.