طراحي و بررسي ساختار يك پپتيد با استفاده از الگوي سم مار كبري

به همت پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس، يك پپتيد با ساختار غالب بتا و با استفاده از الگوي سم نوروتاكسين مار كبري طراحي و بررسي شد.

کد خبر: ۲۷۸۹۱

يکشنبه - ۰۳ خرداد ۱۳۸۸ / May 24, 2009

به گزارش گروه علمي و آموزشي «شبکه خبر دانشجو»، طراحي پروتئين و تعيين كمترين مصالح لازم براي شكل‌گيري ساختارهاي پايدار شبه پروتئين، هم اكنون موضوع بسياري از تحقيقاتي است كه در سراسر دنيا انجام مي‌شود و طي سال‌هاي اخير دستاوردهاي بسياري به همراه داشته است.

دكتر آداك نصيري پور، دانش آموخته رشته زيست شناسي گرايش بيوفيزيك كه اين پژوهش در قالب رساله دكتراي تخصصي وي ارائه شد، اظهار داشت: آلفا نوروتاكسين سم مار داراي چارچوب سرشتگي مشخص و متشكل از يك هسته دي سولفيدي و سه حلقه است كه هر يك از اين حلقه‌ها يك دمين عملكردي مجزا محسوب مي‌شوند؛ اين مولكول به علت پايداري و اختصاصي بودن زياد براي گيرنده هدف، گزينه مطلوبي براي مطالعات ساختاري عملكردي محسوب مي‌شود.

وي با اشاره به تحقيق خود گفت: در اين پژوهش با اين فرض كه هر يك از حلقه‌ها يا انگشت‌هاي سم آلفا نوروتاكسين قابليت اين را دارند كه همانند يك دمين مجزا سرشته شده و احتمالاً واجد عملكرد نيز باشند، با تقليل ساختار نوروتاكسين سم مار كبري به پپتيدهاي 18 و 31 اسيد آمينه‌اي با استفاده از روش‌هاي كلون كردن و سنتز پپتيد، ساختار و عملكرد اين پپتيدها در محيط آبي بصورت in vitro و in silico مورد بررسي قرار گرفت.

پژوهشگر دانشگاه تربيت مدرس در ادامه تصريح كرد: ساختار پپتيدهاي 18 و 31 اسيد آمينه‌اي در حالت محلول به ترتيب به turn و مخلوطي از sheet و مارپيچ آلفا متمايل، و اثر آنها بر روي گيرنده هاي استيل كولين عضله جوجه با سم نوروتاكسين مادر مقايسه شد.

وي در پايان در خصوص نتايج كسب شده اذعان داشت: داده ها نشان مي دهند كه اين مولكول ها با غلظت بيشتر از 5/0 ميكرومولار اثر خود را اعمال مي كنند و اين اثر بشدت وابسته به دوز است، در حالي كه سم نوروتاكسين مار كبري با غلظت هاي زير 50 نانومولار اثر برگشت پذير نشان مي دهد و هر دو نوع اثر از نوع پس سيناپسي است.

لازم به ذكر است، اين پژوهش با راهنمايي دكتر بيژن رنجبر و با مشاوره دكتر حسين نادري منش از اعضاي هيئت علمي دانشگاه در دانشكده علوم پايه دانشگاه تربيت مدرس انجام شد./انتهاي پيام/