روشی برای افزایش سرعت پیش بینی ساختار دوم پروتئین‌ها كشف شد

به گزارش گروه علمي «خبرگزاري دانشجو»، دل‌آسا آقا میرزایی، دانش آموخته کارشناسی ارشد معماری کامپیوتر دانشگاه صنعتی امیرکبیر در خصوص پروژه روشی برای افزایش سرعت پیش بینی ساختار دوم پروتئین‌ها گفت: یکی از رایج ترین و پرکاربردترین انواع شبکه های عصبی روی پردازنده های گرافیکی پیاده سازی شده که از این شبکه‌ عصبی موازی برای افزایش سرعت پیش بینی ساختار دوم پروتئین‌ها استفاده شده است.

 

وی با اشاره به اینکه با افزایش سرعت و قابلیت پردازشی شبکه های عصبی، توانایی سیستم های مبتنی بر هوش مصنوعی مانند روبات ها افزایش می یابد، افزود: این پروژه دارای قابلیت پردازش حجم بسیار بالایی از داده ها به صورت موازی و در زمان کوتاه است که پردازش فوق سریع داده ها و نیز پردازش با قابلیت موازی سازی بالا از جمله پردازش سریع داده های زیستی از دیگر قابلیتهای طرح ارائه شده است.

 

اين پژوهشگر با اشاره به اینکه شبکه های عصبی از رایج ترین ابزارهای موجود در هوش مصنوعی است که قابلیت بالایی برای موازی سازی داشته و عموما با داده های بسیار بزرگی سروکار دارد، تصریح کرد: در این پروژه با استفاده از قابلیت بالای پردازشی پردازنده های گرافیکی، یکی از رایج ترین و پرکاربردترین انواع شبکه های عصبی، موازی سازی شده و با سرعت بسیار بالایی اجرا می‌شود.

 

وی افزود: پیش بینی ساختار دوم پروتئین ها یکی از چالش برانگیزترین و پیچیده ترین مسائل در علم زیست شناسی است که معمولا با داده های بسیار حجیمی در ارتباط است؛ از این رو، الگوریتم هایی که تاکنون برای این منظور ارائه شده اند، معمولا بسیار زمانبر و پیچیده هستند، بنابراین در این پروژه با استفاده از پردازنده های گرافیکی و اجرای موازی شبکه های عصبی، سرعت اجرای این الگوریتم به صورت قابل توجهی افزایش یافته است.

 

گفتنی است، این پروژه در قالب پایان نامه کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر گرایش معماری کامپیوتر با راهنمایی دکتر صدیقی ارائه و در دانشکده مهندسی کامپیوتر و فناوری اطلاعات دانشگاه صنعتی امیرکبیربه ثبت رسیده است.