دانشجویان دانشگاه آزاد یزد با صدور بیانیهای در خصوص تحریف اندیشههای امام راحل توسط رجایی، مشاور آیتالله هاشمی رفسنجانی خطاب به وی اعلام کردند: آقای رجایی! بر چه اساسی خیانت بزرگ و ظلم نابخشودنی فتنهگران را نادیده میگیرید.
دبیر جامعه اسلامی دانشگاه یزد با اشاره به اظهارات اخیر مشاور هاشمی در دانشگاه آزاد یزد گفت: آقای رجایی! پشت سر امام(ره) باشید تا همچون صانعی، موسوی و کروبی پیاده از قطار انقلاب نشوید.
جمعی از دانشجویان بسیجی دانشگاه آزاد یزد در اعتراض به حضور رجایی مشاور هاشمی رفسنجانی در این دانشگاه بیان کردند بر مبنای کدامین محتوا اصول فلسفی و اعتقادی شیعه را تحریف می کنید.