۶ فروردین ماه سال ۶۸ حضرت امام خمینی یکی از تصمیمات مهم خویش در دوران رهبری را آن هم در آخرین سال حیاتش اتخاذ کرد و آن مسئله عزل آیتالله منتظری از قائم مقامی رهبری بود.
آیت الله منتظری بعد از عزل از قائم مقامی رهبری کاملاً از خط انقلاب فاصله گرفت تا حدی که به طرفدار پروپاقرص منافقین و لیبرال ها تبدیل شد، جریانهای که در زمانهای نه چندان دور منتظری از مخالفان درجه یک آنها بود.