دبیر مجمع تشخیص مصلحت نظام نوشت: احمد آقا را همه میشناسند ولی با خدمات او به رهبر کبیر انقلاب اسلامی کمتر آشنا هستند. احمد آقا مشاوری بسیار زیرک، توانمند و آگاه به امور کشور بود و چندین فتنه بزرگ را خنثی کرد. قهر آیتالله طالقانی، موضوع مفتی زاده، مسأله آیتالله منتظری و آیتالله شریعتمداری با مدیریت ایشان حل شد.
در حالی که طی سالهای اخیر عملکرد جناحی دستاندرکاران موسسه نشرو تنظیم آثار امام(ره) مورد اعتراض دلسوزان انقلاب قرار گرفته، اما متاسفانه باید گفت رنجنامه مرحوم حاج سید احمد خمینی یکی دیگر از قربانیان رویکرد سیاسی مسئولان این موسسه است.
امامجمعه شیراز گفت: پس از فوت امام(ره) مرحوم حجتالاسلام سید احمد خمینی یک تنه در کنار رهبری ایستاد و اعلام کرد «که هرکس خامنه ای را قبول نداشته باشد خمینی را قبول نداشته است».