هدف آیین نامه توسعه مشارکتهای مردمی به شیوه مدیریت هیأت امنایی در مدارس، فراهم آوردن زمینه مشارکت مردمی در ابعاد مختلف و مدیریت مدارس به شیوه هیأت امنایی است و به هیچ وجه تبدیل مدارس دولتی به غیر دولتی هدف نبوده و نیست.
رئیس سازمان مدارس غیردولتی با اشاره به اینکه مدارس هیئت امنایی نباید بر دریافت کمکها مالی از خانوادهها اداره شوند، گفت: در بازرسیها مشخص شد که یک مدرسه مبلغی معادل یک میلیارد تومان بابت فوق برنامه از خانوادهها دریافت کرده است.