بسیج دانشجویی شهرستان سروستان اعلام کرد: از وزارت امورخارجه و علمای دلسوز شیعه خواستاریم این اقدامات ضد تشیع را پیگیری و بر حفظ حقوق مسلمانان و شیعیان در جوامع بین الملل تاکیده ورزیده و نگذارند خون برادرانمان پایمال گردد.
دبیر شورای تبیین مواضع بسیج دانشجویی دانشگاه آزاد مشهد با اشاره به اعلامیه رژیم آل سعود در خصوص اعدام شیخ نمر گفت: اعدام رهبر شیعیان عربستان آغازی بر فروپاشی آل سعود خواهد بود.
بسیج دانشجویی شهید شاهچراغی دانشگاه پیام نور فارس در بیانیهای ضمن محکومیت جنایت آل سعود در اعدام شیخ نمر باقر النمر نوشت: خواستار مواضع انقلابی از مسئولان نظام اسلامی در قبال شهادت شیخ نمر هستیم.
دانشکده علوم قرآنی شیراز در بیانیهای ضمن محکومیت شهادت شیخ نمر نوشت: تا آخر در کنار شیعیان مظلوم عربستان خواهد ایستاد و علاوه بر دعوت از مسلمانان عربستان برای قیام علیه نظام حاکم و فاسد این کشور، آنان را به همدلی و اتحاد فرا میخواند.
بسیج دانشجویی دانشگاه دولتی جهرم اعلام کرد: ما دانشجویان مکتب حضرت روح الله آماده لبیک به ولی امر خود هستیم و اجازه نخواهیم داد ریختن خون آزادگان عالم بیهزینه تمام شود.
فرمانده ناحیه بسیج دانشجویی فارس گفت: قطعا اعدام شیخ نمر توطئه از پیش تعیین شده ای به سرکردگی آمریکا و صهیونیسم است که این بار به دست ال سعود انجام شد.
بسیج دانشجویی دانشگاه جامع علمی کاربردی فارس اعلام کرد: حاکمان ظالم سعودی باید بدانند خون پاک شهید شیخ نمر و تمامی شهیدان راه آزادی و آزادگی، خانه ظلمشان را ویران خواهد کرد.
دبیر آموزش اتحادیه جامعه اسلامی دانشجویان کشور گفت: ما از دولتمردان هیچ توقعی نداریم؛ چرا که دولت کاری نکند بهتر است به دلیل اینکه نهایت کاری که میکند زانو زدن در برابر دشمن است.
تشکل های دانشجویی دانشگاه شیراز در نامهای به ظریف نوشتند: اگر خودتان از موضعگیری صریح و انقلابی بیم دارید از جانب ما سخن بگویید و ملاحظه دولتها را نکنید که پیروزی با ملتهاست؛ بنابراین از جنابعالی و دستگاه سیاست خارجی دولت، اخراج فوری کاردار عربستان سعودی را خواستاریم.
محمدرضا عارف نوشت: از اینکه آغازین روزهای سال جدید میلادی مصادف با اعدام شیخ نمر یکی از رهبران شیعی در عربستان شد بسیار متاسفم؛ امید آنکه همه ادیان الهی برای ریشهکنی تروریسم که ناشی از جهل و تعصبات کورکورانه است تلاش بیشتری کنند.
عضو مجلس خبرگان رهبری در واکنش به اقدام آل سعود در اعدام آیت الله شیخ نمر باقر النمر، تأکید کرد: تردید ندارم که این خون های پاک گریبان آل سعود را خواهد گرفت و بنیانشان را به باد میدهد.