معاون اول رئیس جمهور با تسلیت رئیس دفتر سیاسی حماس، گفت: شهادت اسماعیل هنیه به عنوان یکی دیگر از جلوههای «تروریسم دولتی» و از پیامدهای سکوت مجامع بین المللی در قبال جنایات مستمر رژیم صهیونیستی و نقض آشکار مقررات بینالمللی است.
مسعود پزشکیان، رئیس جمهور در واکنش به ترور اسماعیل هنیه در تهران گفت: ایران از تمامیت ارضی و عزت و حیثیت و افتخار و شرف خود دفاع، و اشغالگران تروریست را از اقدام بزدلانه خود پشیمان خواهد کرد.
رئیس تشکیلات خودگردان فلسطین در عین محکومیت شدید اقدام تروریستی رژیم صهیونیستی علیه اسماعیل هنیه، از مردم فلسطین خواست تا در برابر صهیونیستها وحدت و صبر داشته باشند.
سخنگوی وزارت امور خارجه گفت: شهادت برادر مجاهد اسماعیل هنیه در تهران، پیوند عمیق و ناگسستنی میان جمهوری اسلامی ایران و فلسطین عزیز و مقاومت را مستحکمتر خواهد کرد.