به نقل از معاونت علمی، فناوری و اقتصاد دانش‌بنیان ریاست جمهوری، روح‌الله دهقانی در این نامه به مشکل برخی شرکت‌های دانش بنیان اشاره کرده بود که در مراجعه به واحد‌های حقوقی و تشخیص صلاحیت و رتبه بندی در سازمان برنامه و بودجه، مشمول قانون منع مداخله کارکنان دولت تلقی شده و درخواست صدور گواهینامه‌های آنها بلااثر مانده بود.
در این نامه اشاره شده بود که براساس ماده (۶) آیین نامه اجرایی بند (ب) ماده (۱) قانون جهش تولید دانش بنیان مصوب هیات وزیران، به منظور به کارگیری ظرفیت پژوهشی اعضای هیات علمی در تولید اقلام راهبردی و محصولات دانش بنیان، دستگاه‌های اجرایی می‌توانند در راستای فعالیت‌های دانش بنیان با شرکت‌هایی که اعضای هیات علمی، سهامدار و عضو هیات مدیره آنها هستند قرارداد امضا کنند و این شرکتها، مشمول ممنوعیت‌های موضوع بند (ب) ماده (۱۹) آیین نامه طبقه بندی و تشخیص صلاحیت پیمانکاران و تبصره (۲) بند (ب) ماده ۶ آیین نامه تشخیص صلاحیت مشاوران نیستند.
در این نامه درخواست شده بود به منظور تسریع در صدور گواهینامه‌های درخواستی این قبیل شرکت‌های دانش بنیان به ویژه در زمینه تشخیص صلاحیت پیمانکاری و مشاوره، تمهیدات لازم پیش بینی شود.
همچنین حسب مورد آیین‌نامه‌ها و دستورالعمل‌های مربوطه جهت اجرای آیین‌نامه اجرایی بند (ب) ماده (۱) قانون جهش تولید دانش بنیان، بازنگری و به ادارات کل و سایر دستگاه‌های ذی ربط ابلاغ شود.