مجله نیچر، مقاله استاد دانشگاه شریف را منتشر کرد

به گزارش گروه دانشگاه خبرگزاری دانشجو به نقل از روابط عمومی شریف، محمد حسین رهبان عضو هیئت علمی دانشکده‌ی مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف با همکاری محققین دانشگاه‌های Harvard و MIT موفق به چاپ مقاله‌ای با عنوان «بهبود نمایه‌ سازی مبتنی بر تصاویر میکروسکوپی با مدل‌ سازی ناهمگونی تک سلوله» در مجله‌ معتبر نیچر شد.

بر اساس این گزارش؛ تکنولوژی‌های خوانش اطلاعات زیستی که دارای دقت تک سلوله هستند، نیاز به روش‌های خلاصه‌ سازی و نمایه‌ سازی جمعیت سلول‌ها که قادر به مدل‌ سازی ناهمگونی تک سلول‌ها باشند را ایجاد کرده است. نمایه یک جمعیت از سلول‌ها، برداری است که اطلاعات جامعی از وضعیت زیستی یک جمعیت از سلول‌ها را ارائه می‌دهد و امکان مقایسه جمعیت سلول‌ها از طریق آن ممکن می‌شود.

 

مقایسه جمعیت سلول‌ها کاربرد‌های فراوانی در کشف داروها، شناسایی تابع ژن‌ها و کشف مکانیزم دارو‌های ناشناخته دارد. در این مقاله، برای مدل‌ سازی ناهمگونی داده‌های تک سلوله، برای تشکیل نمایه یک جمعیت از سلول‌ها، میانگین خوانش‌ها با پراکندگی خوانش‌ها و همبستگی بین جفت خوانش‌ها را با یکدیگر ترکیب می‌کنیم. برای ارزیابی روش پیشنهادی از تکنولوژی میکروسکوپ فلورسنت برای اندازه‌گیری ریخت‌ شناسی سلول‌ها استفاده می‌کنیم و نشان می‌دهیم که نمایه جدید تعریف شده نسبت به نمایه میانگین، که به صورت سنتی استفاده می‌شود، مکانیزم دارو‌ها و تابع ژن‌ها را به صورت معنا دار و قابل ملاحظه‌ای بهتر پیش‌ بینی می‌کند.

مجله Nature Communications یکی از زیر مجموعه‌های دسترسی آزاد Nature Publishing Group است که در سال ۲۰۱۰ ایجاد شده است. این مجله زمینه‌های علوم طبیعی مانند زیست‌شناسی، فیزیک، شیمی و علوم زمین را پوشش می‌دهد. ضریب تاثیر این مجله در سال ۲۰۱۷، ۱۲/۳۵ گزارش شده است. بر اساس پایگاه SJR، نمایه H. این مجله ۱۹۸، معیار SJR آن ۶/۵۸، و جز مجلات Q۱ در زمینه بیوشیمی، ژنتیک، و زیست‌شناسی مولکولی است.

این کار با همکاری با محققین پلتفرم تصویربردای موسسه برود مرتبط با دانشگاه‌های هاروارد و ام آی تی انجام شده است.